A选项错误：条例规定的是付款期限，主要针对交付后的尾款或结算款，并未强制规定必须在合同签订后30日内支付预付款。预付款的支付遵循合同约定。B选项正确：事业单位属于条文中的“机关、事业单位”范畴，其法定最迟付款期限为60日。约定50日内付款，未超过法定上限，且起算点为“交付之日”，符合规定。C选项错误：大型企业的法定最长付款期限是60日，而非90日。D选项错误： “按建设单位拨款进度同比例支付”实质上就是“按照第三方付款进度比例支付款项”，是条例明文禁止大型企业约定的条款，该约定本身因违法而无效，不应遵守。